Detalles del proyecto
Descripción
El objetivo del presente estudio fue identificar y validar polimorfismos de
nucleótidos únicos (SNP) en tres genes, dos de los cuales codifican para
proteínas funcionales (EDAR y HOXC13) y uno para proteína estructural
(KRT31) en fibra y, evaluar su posible asociación con el diámetro de fibra de
alpaca. Un total de 96 alpacas reproductoras no emparentadas fueron elegidas a partir de la evaluación fenotípica mediante los principales indicadores raciales y textiles de un total de 800 alpacas. El análisis de diversidad genética basada en genotipificación de 10 microsatélites (YWLL08, YWLL29, YWLL36, YWLL40, YWLL44, LCA05, LCA08, LCA19, LCA37, LCA66) reporta un total de 128 alelos con niveles de variabilidad genética elevada y baja consanguinidad (HE>0.68, FIS<0.025) y ausencia de estructuración poblacional (K=2) para la población en estudio. Estos tres genes fueron elegidos a partir de 22 genes funcionales y estructurales previamente seleccionados y anotados a partir de 4 genomas de referencia. Un análisis de variabilidad genética, identifico 34 variantes tipo SNP distribuidos en los genes EDAR (21 / 61.7%), HOXC13 (5 / 14.8%) y KRT31 (8 / 23.5%). Todos los genes estuvieron en HWE y mostraron niveles moderados de variabilidad genética (HE>0.3), los genes EDAR y KRT31 mostraron niveles de consanguinidad baja (FIS<0.02) en contraste con el gen HOXC13 (FIS = 0.108). Un análisis de asociación genética entre marcadores SNP de los genes EDAR, HOXC13, KRT31 y diámetro de fibra mediante regresión múltiple bajo modelo aditivo indican que no se detectó asociación con
dicho carácter.
⇒ Resolución de aprobación: RESOLUCION N° 0553-2014-R-UNH
⇒ Número de contrato: 040-2014-R-UNH (01/10/2014)
⇒ Lugar de ejecución: LACHOCC - HUANCAVELICA
nucleótidos únicos (SNP) en tres genes, dos de los cuales codifican para
proteínas funcionales (EDAR y HOXC13) y uno para proteína estructural
(KRT31) en fibra y, evaluar su posible asociación con el diámetro de fibra de
alpaca. Un total de 96 alpacas reproductoras no emparentadas fueron elegidas a partir de la evaluación fenotípica mediante los principales indicadores raciales y textiles de un total de 800 alpacas. El análisis de diversidad genética basada en genotipificación de 10 microsatélites (YWLL08, YWLL29, YWLL36, YWLL40, YWLL44, LCA05, LCA08, LCA19, LCA37, LCA66) reporta un total de 128 alelos con niveles de variabilidad genética elevada y baja consanguinidad (HE>0.68, FIS<0.025) y ausencia de estructuración poblacional (K=2) para la población en estudio. Estos tres genes fueron elegidos a partir de 22 genes funcionales y estructurales previamente seleccionados y anotados a partir de 4 genomas de referencia. Un análisis de variabilidad genética, identifico 34 variantes tipo SNP distribuidos en los genes EDAR (21 / 61.7%), HOXC13 (5 / 14.8%) y KRT31 (8 / 23.5%). Todos los genes estuvieron en HWE y mostraron niveles moderados de variabilidad genética (HE>0.3), los genes EDAR y KRT31 mostraron niveles de consanguinidad baja (FIS<0.02) en contraste con el gen HOXC13 (FIS = 0.108). Un análisis de asociación genética entre marcadores SNP de los genes EDAR, HOXC13, KRT31 y diámetro de fibra mediante regresión múltiple bajo modelo aditivo indican que no se detectó asociación con
dicho carácter.
⇒ Resolución de aprobación: RESOLUCION N° 0553-2014-R-UNH
⇒ Número de contrato: 040-2014-R-UNH (01/10/2014)
⇒ Lugar de ejecución: LACHOCC - HUANCAVELICA
Hallazgos clave
Se excluyó al miembro José Espinoza Babilon con RESOLUCIÒN Nº 0844-2014-R-UNH con fecha 19 de Noviembre del 2014
| Estado | Finalizado |
|---|---|
| Fecha de inicio/Fecha fin | 12/10/14 → 2/02/19 |
Lineas de Investigación
- Ciencias Agropecuarias y Desarrollo Agroindustrial